NGS Workshop:IPA生物路徑分析軟體軟體功能介紹 | 電影影評網
2018年11月7日—講題:IPA生物路徑分析軟體軟體功能介紹講者:蔡宜庭工程專員QIAGENIngenuityPathwayAnalysis(IPA)生物路徑分析軟體包含可信的資料來源及分析 ...
講題:IPA生物路徑分析軟體軟體功能介紹
講者:蔡宜庭 工程專員
QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis( IPA )生物路徑分析軟體包含可信的資料來源及分析演算法,為目前全球系統生物學與訊息路徑分析領導品牌,不僅廣泛地被許多科研團體採用,在許多學術期刊中也大量地被引用。
在IPA資料庫中,其資訊為每周更新,並在分析結果提供原始文獻出處,且其文獻資訊為博士級人員人工閱讀,從而提供最正確最詳盡的生物學數據分析解決方案。而在實驗結果分析或是分子搜尋上,IPA不僅能演示單一變因實驗之分子調控,也能整合不同細胞層級之分析數據,如RNA-seq、miRNA和SNP之實驗資料、代謝體學分析及蛋白質體學分析等,讓您在完整的生物系統背景下識別新的目標基因或候選生物標記,顯現出“體學數據” 之重要性。
在IPA生物路徑分析軟體當中,其分析功能可分為資訊查詢以及數據分析服務,在查詢的部分,您可以透過IPA收錄的數百萬筆生物資訊,快速尋找您感興趣的基因、疾病及分子調控方式。而在分子數據意義分析上,IPA提供多樣的分析與結果表示方式,包含生物訊息核心分析 (Core Analysis),使用者可將實驗中的基因體、轉錄體或者蛋白質體資料上傳至IPA,並且透過篩選工具選擇出關注分子,利用IPA尋找相關的生物路徑或者疾病與細胞功能。而比較分析 (Compare Analyses) 可利用Heatmap同時瀏覽多筆資料的,將結果進行全面性的比較。
另外,IPA的數據分析和解釋建立在QIAGEN知識庫的基礎上,因應日趨複雜的生物作用類型以及更大量的體學數據量分析,QIAGEN推出了“IPA進階功能模組”以面對下一階段的訊息路徑分析需求,延伸的工具組旨在幫助您能更快速且精準的了解疾病、基因和上游監管機構網絡之間的因果聯繫。因此在IPA現有功能中,可支持磷酸化蛋白分析、代謝體分析、Isoform變異體分析與miRNA分析。而在分析匹配(Anal...
20200121 IPA使用教學.pdf | 電影影評網
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